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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

云南政协委员热议口岸经济 冀与周边国家共建智慧口岸******

　　中新社昆明1月12日电 (记者 韩帅南)“建议云南与周边国家开展智慧口岸共建，并建立口岸国际多边合作机制。”12日，正在召开的云南省两会上，多位政协委员聚焦口岸经济发展，建议云南加快口岸功能由“通道经济”向“产业经济”转型，与周边国家协同建设智慧口岸等。

　　云南地处中国与东南亚、南亚三大区域结合部，与缅甸、老挝、越南接壤，边境线长4060公里，共有27个口岸。

　　民革云南省委会针对口岸国际合作提出提案，指出与云南毗邻的缅甸、老挝等国家存在口岸基础设施落后、通关便利化程度低等问题。建议云南加强对毗邻国家口岸的援建力度，通过多渠道分享中国经验，推进周边国家加强智慧口岸、国际贸易“单一窗口”建设培训项目，改善边境口岸通关设施条件，加强边境互联互通。同时，进一步巩固与周边毗邻国家的口岸国际合作工作机制。

　　民建云南省委会在提案中建议，云南应强化口岸功能定位，发挥以口岸为枢纽的辐射平台作用，探索推动“口岸+枢纽+通道+平台+产业”协调联动模式，积极打造多元化跨境电商渠道体系，推动“互市贸易+落地加工”“互联网+边民互市”创新发展。积极争创国家加工贸易产业园，构建以口岸为窗口，多维度、多层次辐射体系的沿边开放经济带。

　　云南省政协委员、普洱市政协副主席何卫提出应立足口岸对应国家的资源优势，把每个口岸的发展定位、功能定位、产业定位清晰化，有针对性谋划好口岸通道及产业园区建设前期工作。他还建议，在边境或境外开展精深加工，实现境内外联动，提升产品附加值，争取第三国产品互市贸易试点，逐步扩大边民互市落地加工种类。

　　云南省政协委员、民革云南省委会常委、云南大学国际关系研究院教授贺鉴表示，云南若要打造“头部口岸”，应注重数字经济建设，加强与周边国家的数字合作，与东盟国家开展跨境旅游业务合作。同时注重补齐专业人才短板，尤其要重视与国际关系相关的区域国别研究人才的培养。(完)

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）